Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMARCE1Q969G3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms