Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HLA-CQ95604 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms