Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATL2Q8NHH9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATL2Q8NHH9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms