Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KLHL35Q6PF15 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms