Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NANOGP8Q6NSW7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NANOGP8Q6NSW7 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms