Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
SAMD5Q5TGI4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms