Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SOGA3Q5TF21 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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