Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ARHGEF6Q15052 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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ARHGEF6Q15052 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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ARHGEF6Q15052 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ARHGEF6Q15052 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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