Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PSME4Q14997 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PSME4Q14997 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms