Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTAN1Q13813 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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