Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
ATRQ13535 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
ATRQ13535 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
ATRQ13535 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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