Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CGNL1Q0VF96 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CGNL1Q0VF96 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms