Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MDM2Q00987 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms