Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FBXW4P57775 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FBXW4P57775 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms