Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AFDNP55196 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AFDNP55196 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms