Protein–RNA interactions for Protein: P17036

ZNF3, Zinc finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3P17036 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF3P17036 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF3P17036 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms