Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMARCA5O60264 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms