Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC28A2O43868 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC28A2O43868 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms