Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BHLHE40O14503 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BHLHE40O14503 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms