Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS9

E030018B13Rik, RIKEN cDNA E030018B13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E030018B13RikJ3QMS9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
E030018B13RikJ3QMS9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
E030018B13RikJ3QMS9 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms