Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHTF1Q9UMS5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PHTF1Q9UMS5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PHTF1Q9UMS5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PHTF1Q9UMS5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms