Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A9

Trex2, Three prime repair exonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trex2Q9R1A9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trex2Q9R1A9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trex2Q9R1A9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trex2Q9R1A9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trex2Q9R1A9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms