Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYI7

Dnajb8, DnaJ homolog subfamily B member 8, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb8Q9QYI7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dnajb8Q9QYI7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Dnajb8Q9QYI7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dnajb8Q9QYI7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dnajb8Q9QYI7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dnajb8Q9QYI7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms