Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Sall2Q9QX96 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sall2Q9QX96 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Sall2Q9QX96 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Sall2Q9QX96 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Sall2Q9QX96 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms