Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ybx3Q9JKB3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Ybx3Q9JKB3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Ybx3Q9JKB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ybx3Q9JKB3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Ybx3Q9JKB3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ybx3Q9JKB3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms