Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.89
Ercc6l2Q9JIM3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ercc6l2Q9JIM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Ercc6l2Q9JIM3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Ercc6l2Q9JIM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ercc6l2Q9JIM3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms