Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CLSPNQ9HAW4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CLSPNQ9HAW4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CLSPNQ9HAW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
CLSPNQ9HAW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
CLSPNQ9HAW4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CLSPNQ9HAW4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms