Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESW8

Pgpep1, Pyroglutamyl-peptidase 1, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1Q9ESW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Pgpep1Q9ESW8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pgpep1Q9ESW8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pgpep1Q9ESW8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Pgpep1Q9ESW8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pgpep1Q9ESW8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Pgpep1Q9ESW8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pgpep1Q9ESW8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Pgpep1Q9ESW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Pgpep1Q9ESW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgpep1Q9ESW8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms