Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Dnal4Q9DCM4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnal4Q9DCM4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnal4Q9DCM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms