Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smco2Q9DA21 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Smco2Q9DA21 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smco2Q9DA21 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smco2Q9DA21 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms