Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPQ3

Tomm22, Mitochondrial import receptor subunit TOM22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm22Q9CPQ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tomm22Q9CPQ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tomm22Q9CPQ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tomm22Q9CPQ3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tomm22Q9CPQ3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tomm22Q9CPQ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms