Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col25a1Q99MQ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Col25a1Q99MQ5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Col25a1Q99MQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Col25a1Q99MQ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms