Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SptssbQ925E8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
SptssbQ925E8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms