Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Odf3Q920N1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Odf3Q920N1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Odf3Q920N1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Odf3Q920N1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms