Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Snx18Q91ZR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Snx18Q91ZR2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snx18Q91ZR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms