Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pde6cQ91ZQ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pde6cQ91ZQ1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pde6cQ91ZQ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pde6cQ91ZQ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pde6cQ91ZQ1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
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