Protein–RNA interactions for Protein: Q91X17

Umod, Uromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmodQ91X17 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
UmodQ91X17 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
UmodQ91X17 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UmodQ91X17 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UmodQ91X17 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UmodQ91X17 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
UmodQ91X17 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UmodQ91X17 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UmodQ91X17 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms