Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam3cQ91VU0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam3cQ91VU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fam3cQ91VU0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms