Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clptm1Q8VBZ3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Clptm1Q8VBZ3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clptm1Q8VBZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clptm1Q8VBZ3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms