Protein–RNA interactions for Protein: Q8K341

Atat1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atat1Q8K341 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atat1Q8K341 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atat1Q8K341 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atat1Q8K341 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atat1Q8K341 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atat1Q8K341 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atat1Q8K341 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atat1Q8K341 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atat1Q8K341 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms