Protein–RNA interactions for Protein: Q8K297

Colgalt1, Procollagen galactosyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt1Q8K297 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Colgalt1Q8K297 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt1Q8K297 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Colgalt1Q8K297 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Colgalt1Q8K297 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Colgalt1Q8K297 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Colgalt1Q8K297 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt1Q8K297 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Colgalt1Q8K297 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms