Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LgsnQ8CIX8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LgsnQ8CIX8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LgsnQ8CIX8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LgsnQ8CIX8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LgsnQ8CIX8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms