Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snx8Q8CFD4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Snx8Q8CFD4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Snx8Q8CFD4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Snx8Q8CFD4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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