Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RtknQ8C6B2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RtknQ8C6B2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RtknQ8C6B2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RtknQ8C6B2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RtknQ8C6B2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms