Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKF1

Polrmt, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolrmtQ8BKF1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PolrmtQ8BKF1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PolrmtQ8BKF1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PolrmtQ8BKF1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PolrmtQ8BKF1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms