Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ctdspl2Q8BG15 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ctdspl2Q8BG15 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ctdspl2Q8BG15 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ctdspl2Q8BG15 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms