Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms