Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Atp8b3Q6UQ17 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Atp8b3Q6UQ17 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp8b3Q6UQ17 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp8b3Q6UQ17 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
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