Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rhbdf1Q6PIX5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rhbdf1Q6PIX5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms