Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE87

Cfap206, Cilia- and flagella-associated protein 206, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap206Q6PE87 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap206Q6PE87 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap206Q6PE87 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap206Q6PE87 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms