Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SnrpcQ62241 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SnrpcQ62241 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SnrpcQ62241 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SnrpcQ62241 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms